Para evitar inconvenientes al enfrentarse con equipos con uniformes azules o celestes, el conjunto bananero usa como tercer uniforme un diseño similar al suplente pero de color blanco con pixelado azul, además de pantalones blancos y medias blancas. El uniforme del Unión Magdalena está inspirado directamente en los colores de la bandera del Departamento del Magdalena desde la fundación del equipo en 1953, aunque por muchos años jugó con un uniforme de color blanco.